Hola Fer. Se suele hacer a ojo, hay quienes dominan algún programa de CAD o 3D y lo pintan antes de ponerse a cortar piezas. La mayoría de los proyectos son sacados a ojo, suele ser útil imprimir el plano en 2D a la escala definitiva de la máquina y así te puedes guiar a la hora de construirla.

La otra manera es si tienes una maqueta te puedes guiar por ella y luego escalas las medidas al tamaño de lo que estás construyendo (hay quien tiene mucha suerte la maqueta a la que tienen acceso para fijarse es escala 1:1 XD).